Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTP4A2Q12974 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTP4A2Q12974 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTP4A2Q12974 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTP4A2Q12974 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTP4A2Q12974 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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