Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
AP1B1Q10567 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP1B1Q10567 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms