Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms