Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EMX2Q04743 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms