Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLCB3Q01970 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms