Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms