Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms