Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TMEM258P61165 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms