Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FAM3BP58499 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms