Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV1P50549 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV1P50549 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms