Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP1P29466 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms