Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PLNP26678 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PLNP26678 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PLNP26678 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms