Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRDP23468 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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