Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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PTPRBP23467 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRBP23467 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRBP23467 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRBP23467 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRBP23467 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PTPRBP23467 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRBP23467 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRBP23467 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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PTPRBP23467 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PTPRBP23467 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRBP23467 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PTPRBP23467 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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