Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA1P23193 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms