Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HPGDP15428 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HPGDP15428 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HPGDP15428 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms