Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP2AP11388 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms