Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI2P10070 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI2P10070 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI2P10070 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms