Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLXNC1O60486 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNC1O60486 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms