Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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