Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSDA5PKW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms