Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
U3KPZ7 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
U3KPZ7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms