Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAXBP1Q9Y5B6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms