Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2J1Q9Y385 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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