Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAN1Q9Y2M0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms