Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms