Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BRPF3Q9ULD4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRPF3Q9ULD4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms