Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIMS3Q9UJD0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms