Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MBD1Q9UIS9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms