Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms