Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms