Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM8Q9BZR9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms