Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP9Q99956 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms