Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK1Q96QP1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms