Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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