Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H4Q92759 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms