Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms