Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms