Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms