Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC27Q2M243 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC27Q2M243 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms