Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RRN3P1Q2M238 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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RRN3P1Q2M238 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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