Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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