Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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