Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA1Q15788 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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