Protein–RNA interactions for Protein: Q14061

COX17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX17Q14061 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COX17Q14061 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
COX17Q14061 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COX17Q14061 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COX17Q14061 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms