Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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