Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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