Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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UBE2V1Q13404 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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UBE2V1Q13404 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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UBE2V1Q13404 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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UBE2V1Q13404 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
UBE2V1Q13404 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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