Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDE4DQ08499 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms