Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKCDQ05655 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms